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2009학년도 총학생회장 입후보 등록이 10월 12일부터 시작, 17일까지 6일간 진행된다.
입후보 등록 조건은 △4학기 이상 등록을 필한 자 △직전학기 학사경고자 또는 누적 2회 학사경고자가 아닌 자 △총·부학생회장 2인 1조로 공동입후보하여 회원 50인 이상의 추천을 받은 자 △직전학기까지 평균평점 2.7점 이상인 자 또는 지도교수 및 주임교수의 추천을 받은 자 △학칙에 의해 징계를 받은 사실이 없는 자(단 근신처분을 받은 사실이 있으나 그 기간이 만료된 자는 예외로 함) 등을 충족해야 한다.

학과학생활동협의회 회원들로 이루어진 제1선거관리위원회에서는 △학생회칙의 변경에 따른 선거 시행세칙 중 각 조항 번호 수정 △학생의 과반수가 투표하지 않았을 때 재투표에 대한 조항 신설 △부적절한 단어 수정 △서포터즈에 대한 항목 명시 등을 골자로 한 선거시행세칙 개정1판을 11일 발의했다. 이에 따라 이번 총학생회장 선거는 바뀐 선거시행세칙에 의해 진행된다.

한편 부학생회장을 위원장으로 하는 제2선거관리위원회는 총학생회장 선거 기간 동안 여학생회장과 기숙사자치회장 선거를 동시에 실시한다고 밝혔다. 입후보 자격은 여학생회장은 △4학기 이상의 등록을 필한 자 △직전학기 학사경고자 또는 누적 2회 학사경고자가 아닌 자야 한다. 기숙사자치회장은 △기숙사에 3학기 이상 거주한 자 △사생수칙에 의해 20점 이상에 해당하는 제재를 받지 않은 자 △직전학기 학사경고자 또는 누적 2회 학사경고자가 아닌 자여야 한다.